Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21974F6W3F3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21974F6W3F3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21974F6W3F3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21974F6W3F3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21974F6W3F3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms