Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syngap1F6SEU4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngap1F6SEU4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms