Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd35E9Q9D8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd35E9Q9D8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd35E9Q9D8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd35E9Q9D8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd35E9Q9D8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd35E9Q9D8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd35E9Q9D8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd35E9Q9D8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms