Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Urb2E9Q7L1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Urb2E9Q7L1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Urb2E9Q7L1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
Urb2E9Q7L1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Urb2E9Q7L1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms