Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdhb9E9Q5G2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms