Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccdc71lE9Q4T4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccdc71lE9Q4T4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccdc71lE9Q4T4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccdc71lE9Q4T4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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