Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ApobE9Q414 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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