Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Y8

Gm6811, Predicted gene 6811, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6811E9Q3Y8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6811E9Q3Y8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm6811E9Q3Y8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6811E9Q3Y8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms