Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tarbp1E9Q368 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tarbp1E9Q368 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tarbp1E9Q368 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Tarbp1E9Q368 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms