Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc4E9Q236 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc4E9Q236 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcc4E9Q236 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms