Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fndc1E9Q043 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fndc1E9Q043 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fndc1E9Q043 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fndc1E9Q043 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fndc1E9Q043 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms