Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lmo7E9PYF4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Lmo7E9PYF4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmo7E9PYF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmo7E9PYF4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187 ms