Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srp54bE9PXC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srp54bE9PXC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms