Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Rsf1E9PWW9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rsf1E9PWW9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rsf1E9PWW9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rsf1E9PWW9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms