Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim5E9PV98 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim5E9PV98 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim5E9PV98 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms