Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Syde2E9PUP1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syde2E9PUP1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syde2E9PUP1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms