Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca3bE9PUL3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca3bE9PUL3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca3bE9PUL3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca3bE9PUL3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca3bE9PUL3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca3bE9PUL3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clca3bE9PUL3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca3bE9PUL3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3bE9PUL3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms