Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1110002E22RikE0CYV9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1110002E22RikE0CYV9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms