Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930558K02RikE0CXC6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930558K02RikE0CXC6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930558K02RikE0CXC6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms