Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
5430403G16RikD3Z5L4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms