Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim12cD3Z3L3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim12cD3Z3L3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms