Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf1D3YY23 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf1D3YY23 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf1D3YY23 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms