Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim30cD3YVI9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms