Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx8D3YU81 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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