Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd8B9EJ80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd8B9EJ80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms