Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cspp1B2RX88 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cspp1B2RX88 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cspp1B2RX88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms