Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AU015836B2RUM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AU015836B2RUM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AU015836B2RUM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU015836B2RUM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms