Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al2bA9Z055 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al2bA9Z055 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al2bA9Z055 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms