Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ism1A2ATD1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ism1A2ATD1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms