Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn1aA2APX8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scn1aA2APX8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn1aA2APX8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms