Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FocadA2AKG8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FocadA2AKG8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FocadA2AKG8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms