Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Frmpd1A2AKB4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Frmpd1A2AKB4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Frmpd1A2AKB4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Frmpd1A2AKB4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Frmpd1A2AKB4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms