Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ambra1A2AH22 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ambra1A2AH22 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ambra1A2AH22 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms