Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Szt2A2A9C3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Szt2A2A9C3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Szt2A2A9C3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Szt2A2A9C3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms