Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm2A2A7B5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Prdm2A2A7B5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Prdm2A2A7B5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prdm2A2A7B5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms