Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo47A2A6H3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo47A2A6H3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms