Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gpatch8A2A6A1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Gpatch8A2A6A1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Gpatch8A2A6A1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Gpatch8A2A6A1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms