Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam171a2A2A699 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171a2A2A699 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171a2A2A699 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms