Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgap3A2A559 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pgap3A2A559 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pgap3A2A559 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pgap3A2A559 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms