Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1bA1Z198 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms