Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Speer3W4VSP1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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