Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms