Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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