Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Clip2Q9Z0H8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Clip2Q9Z0H8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Clip2Q9Z0H8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms