Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav3Q9R0C8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms