Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp1Q9QY53 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms