Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim44Q9QXA7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim44Q9QXA7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms