Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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