Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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