Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms